Ищите в интерфейсе программы StrongDC++, специальную закладку LIMITS, то есть ограничения. Ну и там выставляете нужные вам параметры. Кстати, и закачка одновременного большого кол-ва файлов, так же капитально потребляет ресурсы.

Многие сети сами ограничивают закачки и раздачи, например для моей сети это 100мб, и в настрйках можно выставить скорость отдачи вплоть до 1кб/c. И кстати никогда не слышал что компьютеры зависают от закачек)